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近年來，開始考慮用小麥代替玉米喂豬，因為因為玉米霉菌污染給養豬生產特別是母豬繁殖性能造成了很大的不良影響。玉米胚大，水分大，一般新收獲玉米的水分在20%到35%，并且吸濕性強，使儲藏穩定性大大降低，帶菌量大，容易酸敗。

玉米赤霉烯酮具有雌激素樣作用，能造成動物急慢性中毒，引起動物繁殖機能異常甚至死亡，可給畜牧場造成巨大經濟損失。雖然玉米赤霉烯酮也會對小麥有污染，但玉米中玉米赤霉烯酮的檢出率為45%，最高含毒量可達到2909mg/kg，而小麥的檢出率為20%，含毒量為0.364到11.05mg/kg。這只是其中的一項，其實在大部分菌種污染中，玉米的受染程度都相對較高。

而小麥除了受污染程度低之外，在營養方面來看，作為飼料原料還有諸多優勢。跟玉米相比，小麥的蛋白質和氨基酸含量要高出5%，非植酸磷含量要高出0.11%，可以節省一些蛋白質、磷酸氫鈣的使用成本。另外，小麥的粗脂肪含量比玉米低1.99%，在一定程度上改善肉胴體品質。同時，小麥比玉米生長周期長，雜菌相對較少，有利于生豬的健康生長。

需要注意的是，小麥作為飼料原料時也有一定的缺點，如小麥中含有較多的抗營養因子——非淀粉多糖，因此，小麥的消化能較低，所以，在替換玉米為小麥時，需要添加一定的小麥復合酶。為了使飼料營養成分達到平衡，開始部分替代玉米，保育豬日糧中玉米的30%到40%、生長豬40%到50%、育肥豬60%到70%，小麥總比例在20%到30%時，普通型小麥復合酶飼料添加量為每噸500克到600克，隨著小麥的添加量增加，小麥復合酶的比例逐漸調高，到小麥代替全部玉米時添加量在每噸1公斤。另外，小麥部分代替玉米可有效節約部分蛋白原料如豆粕，但豆粕的用量下降會導致賴氨酸、蘇氨酸等含量下降，為了達到氨基酸平衡，這時需要添加人工合成的氨基酸。

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